新疆生产建设兵团第三师五十一团医院于1983年11更名而来，其前身为自治区农垦厅巴楚总场卫生所（1960年）、农三师五十一团卫生队（1969年10月）、喀什地区五十一团卫生队（1975年），现有职工220人，其中高级职称3人、中级职称19人；专业技术人员占比95 %，其中医师47人、护士96人、医技16人；编制床位100张，开放床位120张；是一所集医疗、预防、保健、康复于一体的综合性医院。

在师市总医院的领导下，坚定以二级医院为发展定位，以提升疑难危重症疾病诊疗能力为重点。设立职能科室3个、业务科室10个，下设连队卫生室20个；开设内、外、妇产、中医、口腔、检验、放射等13个科室，于2022年新增业务用房10800㎡，现有医疗用房18953㎡，占地面积达50508㎡；配置螺旋CT两台、DR机两台、彩色B超诊断仪、电子胃镜和肠镜、全自动生化分析仪、全自动血球分析仪、呼吸机、麻醉机、中医康复理疗等医疗设备。

全院完成门诊人次量6.2万人次，其中急诊1500人次;住院5010人次，手术131人次。治愈为70 %，好转率为29%，死亡率为0.005%。平均住院日为7.2天。抢救危重病人310人次，抢救成功率达90%。出入院诊断符合率>92 %，床位使用率73%。全年收入3821万元,其中药品收入占31%;人均门诊费用为182元,人均住院费用为1610元。