四十四团医院在2007年由原52团医院和原44团医院合并而成，2018年师办师管后院址由金墩镇搬迁至图木舒克市锦绣街道，为第三师卫生健康委员会管理的正科级的公益二类事业单位，经费实行差额预算管理。四十四团医院自2024年2月托管图木舒克市社区卫生服务中心业务工作，四十四团社区卫生服务中心同归并四十四团医院统一管理。

医院目前设在锦绣街道办事处服务楼内，位于第一、二层楼东区，总建筑面积3000平方米，固定资产总额1508.16万元。核定事业编制89名，目前在职94人，在编79人，其中管理3人，专业技术91人。研究生1人，本科15人，大专62人；高级职称3人，中级职称25人。主要承担四十四团8719人口和图木舒克市城区73097人口的基本医疗卫生、基本公共卫生服务、疾病预防控制、家庭医生签约服务等工作。设置床位13张，开放床位13张。

四十四团医院拥有(DR)X光机1台、经颅多普勒诊断仪1台、彩超B超2台、心电图机5台、动态血压和动态心电图仪各1台、多参数心电监护仪1台、除颤仪1台、麻醉机1台、自动生化分析仪2台、血球分析仪3台、尿十项分析仪4台、呼吸机1台、洗胃机1台、牙科治疗床2台、颈腰椎治疗多功能牵引床一台、经颅磁脑病生理治疗仪1台、电脑中频治疗仪1台、电脑中频治疗仪（推式）2台、蒸汽熏蒸仪6台、电针治疗仪8台、红外线治疗仪15台、圣手推拿仪2台、红外线光灸疗机2台等其他医疗设备。能够开展内、外、妇、儿、口腔科及中医特色康复诊疗等10余专科，承担常见病、多发病的诊治和急诊抢救、应急救援及双向转诊等工作。全方位承担国家14类基本公共卫生服务项目和家庭医生签约服务等工作。

四十四团医院将以“团结、奋进、求精、务实”的精神，齐心协力、拼搏进取，突出抓好基本公共卫生服务项目工作，做好基本医疗工作，打造康复医疗亮点，实现跨越式发展。