第三师总医院四十六团分院地处塔克拉玛干大沙漠和塔里木盆地西部边缘，东北部与第三师前进水库及麦盖提县库木库萨尔乡毗邻，西与麦盖提县尕孜库勒乡接壤，南与麦盖提县克孜勒阿瓦提乡相邻，东接塔克拉玛干沙漠，位于新疆喀什地区麦盖提县城东南16.5公里处。辖区人口0.4万。医院始建于1966年，最早是农三师前进四场卫生队，1998年11月正式更名为四十六团医院，2020年成立医共体，更名第三师总医院四十六团分院。整合医院、疾病预防控制中心、妇幼保健站、计划生育技术服务站，是一所集医疗、预防、保健、康复、健康教育、计划生育技术指导六位一体的综合性医疗卫生服务机构；属于城镇职工基本医疗保险定点医疗机构。

医院占地面积5457平方米，建筑面积3367平方米；2013年建医院辅助用房，建筑面积600平方米；2016年建医院住院部，建筑面积1035平方米，2020年新建发热门诊200平方米。年门诊诊疗0.8万余人次，出院0.045万余人次，医疗服务范围为团部及周边地方乡村。

医院开放床位20张，设有全科、内科、外、妇科、儿科、中医科、检验室、B超心电室、放射室、药剂科、公共卫生科等部门科室。人力资源建设：现有人员38人，卫生专业技术人员38人（其中在编20人、备案制14人、大学生锻炼岗1人、三支一扶支医1人、志愿者1人、聘用1人），财务人员1人，临聘2人（其中救护车司机1人，警卫1人）。专业技术职称副高3人；中级11人；初级26人，其余均未取得职称人员。

医院现有彩色多普勒超声诊断仪、数字化X线成像设备－DR、黑白B超、多导心电图机、500mAX光机、心电监护仪、全自动生化分析仪、半自动生化分析仪、全自动血球分析仪、电解质分析仪、凝血四项分析仪、尿十项机、牵引床、胎心监护仪、乳腺诊断仪、微波治疗仪、呼吸机、除颤仪、洗胃机、制氧机、超声雾化吸入器、输液泵、注射泵等设备。

秉承“爱岗敬业、团结奉献、科学严谨、救死扶伤”医院精神，坚持“以病人为中心，以医疗和服务质量为核心，办百姓信赖、社会满意、政府放心的基层医院”办院方针，发挥基层卫生服务网络的作用，为人民群众提供安全、有效、方便、价廉的医疗卫生服务。